Vous pouvez m'aider à faire de la science en comptant des chromosomes!
Hello, peut-être que vous ne le savez pas encore mais je travaille sur une petite bestiole qui répond au joli nom de Adineta vaga. Il s'agit d'un animal microscopique de la famille des rotifères (très commun mais méconnu). L'animal en question est intéressant pour pas mal de choses mais une des raisons de notre intérêt d'étudier Adineta vaga est sa capacité à réparer son ADN.
Un peu de contexte:
L'ADN est une molécule qui donne la recette de fabrication d'un être vivant et se retrouve dans les animaux sous forme de plusieurs chromosomes. À certains stades du développement d'une cellule, les chromosomes sont condensés. Chez A. vaga, à cette étape, les chromosomes ressemblent à des boules plus ou moins allongées. L'ensemble des chromosomes s'appelle le "karyotype".
L'expérience :
Récemment, j'ai fait une expérience dont le but est de compter les chromosomes de A. vaga, (faire le "karyotypage"). Nous connaissons le nombre attendu chez un individu normal, mais dans mon expérience, je pense que ce nombre peut changer. Pour vérifier ça, j'ai pris des photos de l'ADN grâce à une molécule spéciale qui rend l'ADN fluorescent. Le problème est que parfois les chromosomes sont l'un au-dessus de l'autre, et donc sur une image en 2D, on ne compte qu'une "tache" fluorescente alors qu'il devrait y en avoir 2. Pour résoudre ce problème nous prenons plein de photos à différentes couches que nous superposons pour reconstruire le karyotype en 3D.
Pourquoi m'aider ?
J'ai deux problèmes pour compter. 1. Tout d'abord, il n'est pas toujours facile de distinguer les chromosomes, car parfois il y en a deux collés, et parfois je rate un petit chromosome. Pour éviter ça, j'ai besoin de l'avis d'autres personnes. Et deuxièmement, je suis biaisé en faveur de mon hypothèse, car je sais ce que j'attends et je sais sur quelles images je dois voir plus ou moins de chromosomes. Donc, j'ai besoin d'un regard neutre pour compter les chromosomes (idéalement d'une personne qui ne sait pas combien de chromosomes il faudrait compter sur une image).
Il y a un autre avantage à demander l'avis du public : si plusieurs personnes comptent sur la même image, je peux faire des statistiques plus robustes et prendre la moyenne des nombres comptés par plusieurs personnes différentes. Je profite donc un peu de votre sagesse collective !
Comment m'aider ?
Pour bien compter les chromosomes, vous pouvez suivre ce petit guide:
- Certains navigateurs web ne supportent pas l'affichage des chromosomes en 3D. J'ai testé sur Google Chrome et ça fonctionne avec ce navigateur
- Pour rapporter le comptage, utiliser un nom d'utilisateur unique dont vous pouvez vous souvenir facilement (par exemple, votre prénom et la première lettre de votre nom). De cette façon vous ne devrez pas compter plusieurs fois la même image.
- Pour naviguer dans l'image en 3D, vous pouvez utiliser la molette de la souris pour zoomer/dézoomer, appuyer sur MAJ + cliquer pour faire glisser l'image. Si vous cliquez-glissez sur l'image, vous pouvez changer l'orientation de la caméra.
Merci beaucoup pour votre aide !
Le comptage, c'est ici:
Pour éviter de comptez deux fois la même image, il y a un système qui se base sur un nom d'utilisateur (vous pouvez utiliser un pseudo), si vous actualisez la page ou si vous y revenez plusieurs fois à différents moments, utilisez le même pseudo. Le système garde votre pseudo en mémoire donc n'utilisez pas vos mots de passes ultra-secrets. Note: si aucune image ne s'affiche, il se peut que ce soit à cause du navigateur.
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